• EpiInfo (gratuit)
• Excel de la suite Microsoft Office (payant). Excel est très souvent acquis par les Universités, vérifiez avant d’acheter la licence vous-mêmes
• Libre Office (gratuit). Il s’agit de la version libre de la suite Microsoft Office. L’équivalent d’Excel se nomme Calc
• Stata (payant)
• SAS (payant). Documentation ici et là
• R (gratuit). Une interface (surcouche) plus conviviale est disponible : R Studio

R est un des logiciels libres les plus utilisés par les statisticiens en raison de la richesse de ses fonctionnalités. Cette richesse est notamment due à ses librairies (ou packages) proposées par la communauté des utilisateurs. Le logiciel dans sa version de base est un peu austère, il est vivement conseillé de l’utiliser via un environnement de développement, le plus couramment utilisé étant RStudio (mais d’autres existent, par exemple Rcmdr).
R n’est pas seulement un logiciel, c’est aussi un langage de programmation : l’utilisation d’une interface comme RStudio facilite grandement l’écriture de lignes de codes. De nombreuses documentations sur le logiciel sont disponibles sur internet. Parmi elles, on pourra consulter :

• • • • • Diaporama d’introduction au logiciel R (68 diapos)
        • Cours d’introduction à R (129 pages)
        • site Begin’R de l’Université de Bordeaux
        • site Premiers pas avec R  sur EduTechWiki.fr
        • Fiches :
          • Fiche aide-mémoire R (fonctions de R les plus courantes)
          • Fiche aide-mémoire des packages dplyr et tidyr (package très utiles !)
      • Package statsBordeaux (développé par un ancien ISP), qui regroupe des fonctions permettant d’analyser un jeu de données (analyse descriptive, production de graphiques, statistique comparative univariable, régression logistique et linéaire…) et de produire le rapport d’analyse (reporting)

• Zotero : logiciel gratuit de gestion de la bibliographie
  • Initiation à Zotero 5 de l’Université de Bordeaux
• Mendeley : cet outil est très similaire à Zotero, et embarque également un outil de suggestion de bibliographie

•  LaTeX
  • Overleaf (éditeur LaTeX en ligne, collaboratif)
  • TexMaker, MixTeX  ou autres (éditeurs LaTeX pour OS).
  • Cours d’introduction à la rédaction de document sur Openclassrooms
  • Cours d’introduction à la création de diaporamas avec Beamer sur Openclassrooms
  • Documentation Overleaf, notamment le tutoriel Learn LaTeX in 30 minutes

• Wepi : outil web gratuit et collaboratif de création et de gestion d’enquêtes en épidémiologie et en santé
• Lime Survey : logiciel d’enquête statistique, de sondage, et de création de formulaires en ligne

• yEd : logiciel libre permettant de créer facilement des diagrammes mais bien plus encore ogiciel d’enquête statistique, de sondage, et de création de formulaires en ligne

• Github : service web d’hébergement et de gestion de développement de logiciels, utilisant le logiciel de gestion de versions Git
• GitLab : logiciel libre de développement collaboratif, également basé sur Git
• Slack : plate-forme de communication collaborative