Publication et intégrité scientifique

Voilà une liste non exhaustive sur la publication scientifique l’intégrité scientifique (impact-factor, h-index, Open Access & preprints, revues prédatrices…) :

PUBLICATION SCIENTIFIQUE
  1. Règles d’autorat
  2. Revues prédatrices
  3 Science ouverte / Open Science
  4. Prépublications / Preprints
  5. Évaluation par les pairs / Peer-reviewing
  6. Indicateurs de notoriété
INTÉGRITÉ SCIENTIFIQUE
  1. Formations et supports à l’intégrité scientifique
  2. Formations et supports à la recherche reproductible
  3. Inconduites scientifiques et rétractations

PUBLICATION SCIENTIFIQUE

  1. Règles d’autorat
    Pour rappel, selon les bonnes pratiques d’autorat d’un papier scientifique, un auteur doit remplir simultanément les 4 conditions suivantes :
         1) Avoir joué un rôle substantiel dans la conception ou l’exécution de la recherche, ou dans l’acquisition, l’analyse et l’interprétation des résultats.
         2) Avoir écrit la première version du manuscrit ou avoir participé à sa révision de façon substantielle.
         3) Avoir approuvé la version du manuscrit qui sera publiée.
         4) Engager explicitement sa responsabilité pour l’ensemble du travail, et être à même de répondre à toutes les questions portant sur son exactitude et son intégrité.
  2. Revues prédatrices
    1. Think. Check. Submit https://thinkchecksubmit.org/translations/french/
    2. CIRAD : Éviter les éditeurs prédateurs http://coop-ist.cirad.fr/editeurs-predateurs
    3. Liste des revues prédatrices : Stop Predatory Journals https://predatoryjournals.com/journals/
    4. Liste des revues prédatrices de Jeffrey Beall https://beallslist.net/
    5. Criteria for Determining Predatory Open-Access Publishers – 3rd edition https://beallslist.net/wp-content/uploads/2019/12/criteria-2015.pdf
    6. Journal Evaluation Tool, Digital Commons at Loyola Marymount University and Loyola Law School, 2017 https://digitalcommons.lmu.edu/cgi/viewcontent.cgi?article=1041&context=librarian_pubs
    7. Rx Communications : How to Spot a Predatory Journal https://www.rxcomms.com/blog/6-ways-spot-predatory-journal/vglasson/
  3. Science ouverte / Open Science
    1. Ouvrir la science https://www.ouvrirlascience.fr/
    2. Index et registres de documents en libre accès :
      1. Revues scientifiques selon la définition de l’OA de Budapest : le Directory of Open Access Journals (DOAJ) de l’OASPA https://doaj.org/
      2. Revues scientifiques selon les principes FAIR : le Free Journal Network (membre de la FOAA https://freejournals.org/
      3. Revues en OA de Sciences Humaines et Sociales par la faculté des lettres de Sorbonne Université https://paris-sorbonne.libguides.com/revues-shs-libre-acces/sites-revues
      4. Politiques des revues scientifiques en matière de droit d’auteur et d’auto-archivage : SHERPA/RoMEO https://v2.sherpa.ac.uk/romeo/
      5. Livres universitaires en OA, pouvant être librement partagés : le Directory of Open Access Books (DOAB) https://www.doabooks.org/
    3. Livres universitaires : la bibliothèque Open Access Publishing in European Networks (OAPEN) [1] https://www.oapen.org/
    4. Guide du Comité pour la Science Ouverte « Je publie, quels sont mes droits ? » https://www.ouvrirlascience.fr/je-publie-quels-sont-mes-droits
    5. OpenCitations https://opencitations.net/
    6. Journal Checker Tool: Plan S Compliance Validator https://journalcheckertool.org/
    7. Extensions de navigateur :
      1. Unpaywall (ONG Our Research) https://unpaywall.org/products/extension
      2. Open Access Button https://openaccessbutton.org/
  4. Prépublications/preprints
    1. CIRAD : Rendre public son projet d’article sur un site de preprints en 7 points https://doi.org/10.18167/coopist/0031
    2. ASAPbio (répertoire de plateformes de prépublications biomédicales) https://asapbio.org/preprint-servers
    3. PrePubMed (indexe les prépublications d’arXiv q-bio, PeerJ Preprints, bioRxiv, F1000Research, preprints.org, The Winnower, Nature Precedings, et Wellcome Open Research) http://www.prepubmed.org/
    4. Rxivist (combine les prépublications de biologie des plateformes bioRxiv and medRxiv avec les données de Twitter) https://rxivist.org/
    5. PREreview (évaluation de preprints) https://prereview.org/
  5. Évaluation par les pairs / Peer-reviewing
    1. ICMJE : Recommandations pour la conduite, la présentation, la rédaction et la publication des travaux de recherche soumis à des revues médicales, mise à jour de 2019 http://www.icmje.org/recommendations/translations/french2016.pdf
    2. COPE : Ethical guidelines for peer reviewers https://publicationethics.org/node/19886
    3. Identifiant unique d’un évaluateur :
      1. Open Researcher and Contributor ID (ORCID) : https://orcid.org/signin
      2. ResearcherID (Clarivate Analytics) https://www.researcherid.com/#rid-for-researchers
    4. Publons (Clarivate Analytics) : suivi et mise en valeur des évaluations des chercheurs https://publons.com/about/home/
    5. Peer Community In : propose une évaluation qui sera ensuite déposée en OA avec le manuscrit https://peercommunityin.org/
    6. Review Commons : propose une évaluation avant envoi à bioRxiv ou à des revues affiliées https://www.reviewcommons.org/
    7. PREreview – version bêta : propose une évaluation de votre preprint https://prereview.org/
    8. Octopus – version bêta : entend remplacer revues et articles en proposant un dépôt de chaque étape d’un travail scientifique (données, méthodologie, analyse, évaluation…) https://science-octopus.org/
    9. Peeriodicals – version bêta : propose d’être le rédacteur-en-chef de son propre journal virtuel https://peeriodicals.com/
  6. Indicateurs de notoriété
    1. CIRAD : Mesurer l’impact des publications https://coop-ist.cirad.fr/evaluer/mesurer-l-impact-des-publications/1-comprenez-l-interet-de-mesurer-l-impact-des-publications-d-un-auteur
    2. Citations
      1. Nombre de citations d’un auteur, d’un article ou d’une revue :
        1. Publish or Perish (PoP), logiciel qui exploite entre autres le moteur de recherche Google Scholar https://harzing.com/resources/publish-or-perish
        2. Scopus (Elsevier) https://www.scopus.com/home.uri
        3. WoS (Clarivate Analytics) https://mjl.clarivate.com/home ou via l’Université de Bordeaux http://docelec.u-bordeaux.fr/login?url=https://apps.webofknowledge.com
      2. h-index d’un auteur :
        1. Scopus https://www.scopus.com/home.uri
        2. Google Scholar Metrics https://scholar.google.com/
        3. PoP https://harzing.com/resources/publish-or-perish
        4. WoS https://mjl.clarivate.com/home / http://docelec.u-bordeaux.fr/login?url=https://apps.webofknowledge.com
      3. g-index d’un auteur :
        1. PoP https://harzing.com/resources/publish-or-perish
        2. WoS https://mjl.clarivate.com/home/ http://docelec.u-bordeaux.fr/login?url=https://apps.webofknowledge.com
    3. Facteurs d’impact des revues :
      1. Impact Factor des Journal Citation Reports (Clarivate Analytics), nécessite un abonnement de l’institution https://clarivate.com/webofsciencegroup/solutions/journal-citation-reports/
      2. Scientific Journal Rank (SJR) de SCImago (Elsevier) https://www.scimagojr.com/journalrank.php
      3. CiteScore de Scopus (Elsevier) https://www.scopus.com/home.uri
      4. Eigenfactor (Clarivate Analytics) http://www.eigenfactor.org/projects/journalRank/journalsearch.php
      5. Article Influence d’une revue [2] (Clarivate Analytics)
    4. Mesures alternatives d’impact/Altmetrics ou Article-Level Metrics (ALM)
      1. CIRAD Se familiariser avec les altmetrics https://coop-ist.cirad.fr/evaluer/les-altmetrics/1-que-sont-les-altmetrics
      2. Gratuites
        1. Altmetric Bookmarklet https://www.altmetric.com/products/free-tools/bookmarklet/
        2. PLOS https://plos.org/publish/metrics/
      3. Payantes
        1. Impactstory (ONG Our Research) https://profiles.impactstory.org/
        2. PlumX (Plum Analytics) https://plu.mx/sign_in

[1] Elle contient le texte intégral de livres en OA, qu’ils puissent être librement lus uniquement ou également partagés. Les livres de la bibliothèque OAPEN qui ne peuvent qu’être librement lus ne sont pas inclus dans le DOAB.

[2] Équivalent à l’Eigenfactor d’une revue par article publié. http://help.incites.clarivate.com/incitesLiveJCR/glossaryAZgroup/g4/7790-TRS.html

INTÉGRITÉ SCIENTIFIQUE

  1. Formations et supports à l’intégrité scientifique
    1. L’Unité Régionale de Formation à l’Information Scientifique et Technique de Bordeaux (URFIST) http://weburfist.univ-bordeaux.fr/presentation/
    2. MOOC « Intégrité scientifique dans les métiers de la recherche » – Session 3, Université de Bordeaux, France Université Numérique https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:Ubordeaux+28007+session03/about
    3. MOOC « Éthique de la recherche », Université de Lyon, France Université Numérique https://www.fun-mooc.fr/fr/cours/ethique-de-la-recherche/ 
    4. Formation doctorale en ligne « Éthique et intégrité scientifique » de Paris Sciences et Lettres (PSL), Sensibilisation à l’Histoire, l’Épistémologie et l’Éthique des sciences https://collegedoctoral.psl.eu/formation-doctorale/ethique-et-integrite-scientifique/sensibilisation-a-lhistoire-lepistemologie-et-lethique-des-sciences-themes/
    5. « L’Intégrité en recherche », Séminaire du 14 Décembre 2018, Inserm, BPH et Université de Bordeaux https://www.bordeaux-population-health.center/news/actus/seminaire-integrite-en-recherche-le-bph-affirme-sa-demarche-qualite-integrite/
    6. COPE : Principles of Transparency and Best Practice in Scholarly Publishing https://publicationethics.org/node/19881
  1. Formations et supports à la recherche reproductible
    1. MOOC « Recherche reproductible : principes méthodologiques pour une science transparente » – Session 3, Inria, France Université Numérique https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:inria+41016+self-paced/about
    2. « Vers une recherche reproductible ? Faire évoluer ses pratiques », ouvrage dirigé par l’URFIST de Bordeaux https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02144142
  1. Inconduites scientifiques et rétractations
    1. COPE : Retraction guidelines https://publicationethics.org/node/19896
    2. COPE : Cooperation between research institutions and journals on research integrity cases https://publicationethics.org/node/19891
    3. « Le plagiat académique – Comprendre pour agir » de Michelle Bergadaà, L’Harmattan, 2015 https://irafpa.org/publications/livre-plagiat-academique/sommaire-livre/ (contient notamment un chapitre sur les profils de délinquant : manipulateur, fraudeur, bricoleur, tricheur